谋反罪下狱。
李峤参与审理,却畏惧武三思威权而无所作为,致使王同皎冤死,天下称怨,是年七月,李峤进位中书令。
他因铨选混乱,上疏引咎辞职,并奏陈十余条时政得失。唐中宗认为李峤能自陈失政,下诏抚慰,让他官复原职。
神龙三年太子李重俊发动兵变,诛杀武三思父子,又攻打宫城,最终兵败被杀,史称景龙政变。
当时唐中宗与韦皇后在兵变时登玄武门避乱,李峤则与杨再思、苏瑰、宗楚客、纪处讷拥兵二千人,屯于太极殿前,闭门自守。
后来宗楚客指使给事中冉祖雍,奏称前宰相魏元忠犯有大逆之罪,李峤也随声附和,结果遭到唐中宗的训斥。
景龙二年李峤兼任修文馆大学士、监修国史,进爵赵国公,景龙三年李峤被免去中书令之职,改任特进、兵部尚书、同中书门下三品。
当时宗楚客与纪处讷潜怀奸计,广结朋党。李峤身为宰相,却以唯诺自保,对朝政无所匡正。
景龙四年唐中宗暴崩。韦皇后秘不发丧,连夜召宰相李峤、苏瑰、宗楚客等十九人入禁中,商议后事,当时太平公主与上官昭容起草遗诏,命温王李重茂即位。
由韦皇后临朝理政,并让相王李旦辅政,但宗楚客等韦氏亲信,却以嫂叔不通问为由,建议削去李旦的辅政之责。
诸宰相中只有苏瑰表示反对,李峤等人皆一言未发,最终李旦被削去辅政之责,韦氏以皇太后临朝摄政。
李峤还密奏韦后,认为不宜将相王李旦之子李成器、李隆基等人留在京城。
是年六月,李隆基发动唐隆政变,诛杀韦皇后及其亲信党羽,拥立李旦为皇帝,史称唐睿宗。七月,李峤被贬为怀州刺史,不久以年老致仕。
先天元年唐睿宗退为太上皇,太子李隆基即位,史称唐玄宗,他在宫中发现了李峤当初的奏表,将其宣示于朝臣。
中书令张说认为桀犬吠尧,各为其主,不应追究李峤的罪责,唐玄宗遂让李峤随其子虔州刺史李畅到虔州赴任。
开元二年李峤又遭到监察御史郭震的弹劾,被追究韦后之乱时身为宰相,不能匡正的罪责。他虽已致仕,仍被贬为滁州别驾,后来李峤又被改任为庐州别驾,不久病逝于任上终年七十岁。
政治上李峤在高宗年间曾随军征讨岭南僚乱,并入僚洞宣抚,成功招降叛军,抑制酷吏政治。
李峤不惧酷吏淫威,上疏为含冤入狱的狄仁杰等大臣辩冤,他在武则天晚年时,又与桓彦范先后上奏皇帝,建议为在酷吏政治中含冤而死的大臣洗冤昭雪,最终得到皇帝的批准。
李峤是武后、中宗时期的文坛领袖,与苏味道并称苏李,又与杜审言、崔融、苏味道并称文章四友,晚年更被尊为文章宿老,深得时人推崇。
他的文章善于隶事用典,讲求骈偶,辞采华美,堪称大手笔,开元名相张说赞其文如良金美玉,《旧唐书》则称其文学为一代之雄。